Las moscas son frecuentemente portadoras de helmintos.
Varios nematodos, como Parafilaria bovicola,Thelazia spp. y Heterotylenchus autumnalis pueden hallarse en varias especies de moscas, y en especial en la mosca de la cara (Bech-Nielsen, 1982, Chirico, 1994, Geden, 1982, O'Hara, 1989).
La telaziosis, una infección por un helminto del ojo que afecta al vacuno, ovejas, caballos y cabras, se transmite esencialmente por la mosca de la cara, Musca autumnalis (Greenberg, 1973, Lancaster, 1986, O'Hara, 1991, Stork, 1979).
También se han encontrado diversas especies de moscas portando huevos de Ascaris, Trichurisy Ancylostoma, y, por tanto, puede que jueguen un papel en la trasmisión de estas helmintiasis (Dipeolu, 1982, Monzon, 1991, Oyerinde, 1976, Umeche, 1989).
La mosca doméstica es un vector de la cestodosis aviar (Abrams, 1976). En avícola, la coccidiosis puede también trasmitirse a través de las moscas, aunque ésta no es la principal forma de trasmisión de la enfermedad (Greenberg, 1973, Milushev, 1978). ).